本计划非常重视每一位参加者的隐私和数据安全，所有个人资料及基因数据的收集均符合香港法例第 486 章《个人资料（私隐）条例》规定，并受严格的保密措施保护。
- 保存数据
基因组中心会把你的个人资料、医疗纪录及「全基因组测序」数据列为机密资料，并妥善储存至设于香港本地的基因组中心数据库内。
- 查阅数据
只有获授权的指定计划团队成员，才可查阅你的医疗纪录及基因组数据，用作分析你的情况及撰写报告。他们只会在为你进行临床诊断及护理时，才使用能辨识你身份的个人资料。如有需要，你可以向基因组中心申请查阅有关你的基因组资料。
除此以外，基因组中心只会分享你的「去识别化」（没有你个人资料的）数据作研究用途。 合资格的研究机构及相关人员必须通过基因组中心的研究伦理委员会审批，才能透过基因组中心提供的指定平台阅覧及分析数据。